A Pró-Reitoria de Ensino tem por objetivo incentivar e estimular as atividades de ensino do Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Sul de Minas Gerais, visando criar condições favoráveis à melhoria do funcionamento da vida acadêmica e da qualidade dos cursos ofertados nas diversas modalidades: profissionalizante (integrado, subsequente, PROEJA e EAD) superiores (tecnologia, licenciaturas e bacharelados). Além do assessoramento a gestores acadêmicos, a Pró-Reitoria de Ensino tem a função de coordenar atividades curriculares em articulação com os campi, registrar e gerenciar informação de dados relativos ao ensino e expedir documentos diversos.